Šta je PDB datoteka?

Kako otvoriti, urediti i pretvoriti PDB datoteke

Datoteka sa PDB ekstenzijom datoteke je najverovatnije datoteka kreirana u formatu Programske baze podataka koja se koristi za držanje informacija o programu za debagovanje o programu ili modulu, kao što je DLL ili EXE datoteka. Ponekad se zovu simbol datoteke.

PDB datoteke mapiraju razne komponente i izjave u izvornom kodu u svoj konačni sastavljeni proizvod, a koji debugger zatim može koristiti da pronađe izvornu datoteku i lokaciju u izvršnoj verziji na kojoj bi trebalo zaustaviti proces debagovanja.

Neke PDB datoteke mogu umjesto toga biti u formatu datoteke podataka proteina podataka. Ove PDB datoteke su obični tekstualni fajlovi koji čuvaju koordinate u vezi sa strukturama proteina.

Druge PDB datoteke su verovatno kreirane u Palm Database ili PalmDOC formatu datoteka i koriste se uz PalmOS mobilni operativni sistem . Neke datoteke u ovom formatu umesto toga koriste ekstenziju datoteke .PRC.

Kako otvoriti PDB datoteku

Različiti programi koriste sopstvenu PDB datoteku za čuvanje podataka u nekom obliku strukturiranog baze podataka, tako da se svaka aplikacija koristi za otvaranje sopstvenog tipa PDB datoteke. Genious, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio i Pegasus su samo nekoliko primera programa koji mogu koristiti PDB datoteku kao datoteku baze podataka. Radare i PDBparse mogu raditi i za otvaranje PDB fajlova.

Neke PDB datoteke se čuvaju kao običan tekst, kao što su Geneous 'Program Debug Database datoteke, i potpuno su čitljivi ako se otvore u tekstualnom editoru. Ovu vrstu PDB datoteke možete otvoriti bilo kojim programom koji može čitati tekstualne dokumente, kao što je ugrađeni program Notepad u Windowsu. Neki drugi PDB fajlovi i urednici uključuju Notepad ++ i Brackets.

Druge datoteke PDB baze podataka nisu tekstualni dokumenti i korisne su samo kada se otvore sa programom za koji je namenjen. Na primer, ako je vaša PDB datoteka na neki način povezana sa Quicken-om, pokušajte da koristite taj softver da biste pogledali ili uredili PDB datoteku. Visual Studio očekuje da vidi PDB datoteku u istoj fascikli kao DLL ili EXE datoteka.

Možete pregledati i urediti PDB datoteke koje su datoteke Protein Data Bank, u Windows, Linux i MacOS sa Avogadrom. Jmol, RasMol, QuickPDB i USCF Chimera mogu takođe otvoriti PDB datoteku. Pošto su ove datoteke običan tekst, možete otvoriti i PDB datoteku u tekstualnom editoru.

Palm Desktop bi trebao biti u mogućnosti da otvori PDB datoteke koje su u formatu datoteke Palm Database, ali možda ćete morati prvo preimenovati da ima proširenje datoteke .PRC za taj program da ga prepozna. Da biste otvorili PalmDOC PDB datoteku, probajte STDU Viewer.

Kako pretvoriti PDB datoteku

Datoteke programa baze podataka najverovatnije ne mogu biti konvertovane u drugi format datoteke, bar ne sa redovnim alatkom za pretvaranje datoteka . Umesto toga, ako postoji bilo koji alat koji može pretvoriti ovu vrstu PDB datoteke, to bi bio isti program koji ga može otvoriti.

Na primjer, ako morate pretvoriti datoteku PDB baze podataka iz Quicken-a, pokušajte da koristite taj program. Ova vrsta konverzije, međutim, verovatno nije samo malo korištena ali i nije podržana u ovim aplikacijama baze podataka (tj. Verovatno vam nije potrebno pretvoriti ovu vrstu PDB datoteke u bilo koji drugi format).

Datoteke podataka o proteinima podataka mogu se konvertovati u druge formate pomoću programa MeshLab. Da biste to uradili, možda ćete morati prvo pretvoriti PDB datoteku u WRL sa PyMOL-om iz File> Save Image As> VRML menu, a zatim importirati WRL datoteku u MeshLab i koristiti File> Export Mesh As meni za konačno pretvoriti PDB datoteku u STL ili drugi format datoteke.

Ako vam model nije potreban za boju, možete direktno izvoziti PDB datoteku u STL sa USCF Chimera (link za preuzimanje je gore). U suprotnom, možete koristiti istu metodu kao i gore (sa MeshLab-om) za pretvaranje PDB u WRL sa USCF Chimera i zatim izvoziti WRL datoteku u STL sa MeshLab-om.

Da biste pretvorili PDB u PDF ili EPUB , ako imate PalmDOC datoteku, moguće je na više načina, ali najlakše je vjerovatno koristiti online PDB pretvarač poput Zamzara . Možete preneti vašu PDB datoteku na tu web lokaciju kako biste imali mogućnost pretvaranja u te formate, kao i na AZW3, FB2, MOBI , PML, PRC, TXT i druge formate e-knjiga.

Pretvoriti PDB datoteku u FASTA format može se uraditi sa online PDB Meiler Lab-om na FASTA pretvarač.

Takođe je moguće pretvoriti PDB u CIF (format kristalografskog informisanja) online koristeći PDBx / mmCIF.

Napredno čitanje na PDB fajlovima

Više možete pročitati o datotekama programa Database od Microsoft, GitHub i Wintellect.

Ima još informacija o datotekama Protein Data Bank; pogledajte Worldwide Protein Data Bank i RCSB PDB.

Da li se vaš dokument još uvijek ne otvara?

PDB datoteke koje se ne otvaraju pomoću bilo kog alata odozgo, verovatno nisu zapravo PDB datoteke. Ono što se može desiti jeste da pogrešno čitate proširenje datoteke; neki formati datoteka koriste sufiks koji blisko podseća na ".PDB" kada su stvarno nepovezani i ne rade na istom.

Na primer, PDF datoteka je dokument datoteka, ali većina programa odozgo neće ispravno prikazati tekst i / ili slike ako pokušate da ih otvorite ovim programima. Isto važi i za druge datoteke sa slično napisanim proširenjima datoteka, kao što su PD, PDE, PDC i PDO datoteke.

PBD je još jedan koji pripada programu EaseUS Todo Backup i zato je korisno samo kada se otvori pomoću tog softvera.

Ako nemate PDB datoteku, onda istražite proširenje datoteke koju vaša datoteka ima tako da možete pronaći odgovarajući program koji ga otvara ili pretvara.